Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SNAPC1Q16533 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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