Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GTF2H3Q13889 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GTF2H3Q13889 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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