Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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