Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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