Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms