Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms