Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTCQ00610 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms