Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HBBP68871 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HBBP68871 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms