Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms