Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms