Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UTRNP46939 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTRNP46939 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTRNP46939 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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