Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER4P35408 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms