Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms