Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FLJ22447-202ENST00000556569 1312 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AP000322.2-201ENST00000608289 510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL445675.1-201ENST00000603868 1410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 POLR3KP1-201ENST00000449146 342 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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HOXD11P31277 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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