Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD1P28340 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms