Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFE3P19532 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFE3P19532 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TFE3P19532 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFE3P19532 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms