Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms