Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms