Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf172C9J069 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms