Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNSTRNQ9Y448 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNSTRNQ9Y448 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms