Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms