Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms