Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms