Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms