Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms