Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM4Q9C037 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms