Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms