Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms