Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCMH1Q96GD3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms