Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms