Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms