Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMCO5AQ8N6Q1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms