Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP4Q8N2S1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms