Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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