Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYT9Q86SS6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms