Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2AFVQ71UI9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms