Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms