Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXD4L3Q6VB84 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms