Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC12Q6PEW1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms