Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms