Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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