Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms