Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms