Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHC1Q5JVL4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms