Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms