Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms