Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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