Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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