Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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EFNB3Q15768 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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EFNB3Q15768 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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EFNB3Q15768 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB3Q15768 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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