Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms